Структура визначається Положенням про ІОЦ і формується відповідно до штатного розпису Університету. До складу ІОЦ можуть входити сектори, робочі групи тощо.
У складі ІОЦ можуть утворюватися та функціонувати робочі групи для адміністрування та координації роботи фахівців з обчислювальними, телекомунікаційними та іншими інформаційно-технічними системами Університету.
Діяльність секторів ІОЦ, їх кількість, назва та функції визначаються цим Положенням. У структурі ІОЦ діють такі сектори:
- сектор забезпечення освітнього процесу;
- сектор технічного обслуговування засобів обчислювальної техніки;
- сектор інформаційного забезпечення;
- сектор «Центр керування локальною обчислювальною мережею»;
- сектор «Дата-центр».